Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JFS9

Atg4a-ps, Cysteine protease, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atg4a-psA0A0G2JFS9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms