Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H3

Trbv16, T cell receptor beta, variable 16 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv16A0A0B4J1H3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv16A0A0B4J1H3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv16A0A0B4J1H3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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