Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm45645-201ENSMUST00000211470 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Vwa3a-201ENSMUST00000033180 4575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Slc22a8-202ENSMUST00000170817 3398 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm42899-201ENSMUST00000197034 2667 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Nsun7-201ENSMUST00000031109 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Tmem161b-201ENSMUST00000057495 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Trdmt1-202ENSMUST00000124488 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Tmsb15a-202ENSMUST00000113154 544 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm15000-201ENSMUST00000118275 1243 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Snhg17-202ENSMUST00000138592 342 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 1700028P15Rik-202ENSMUST00000139894 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm14225-201ENSMUST00000142310 539 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 BC049715-202ENSMUST00000163640 744 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm21976-202ENSMUST00000180066 831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 D330041H03Rik-203ENSMUST00000180579 605 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Ly6e-208ENSMUST00000188042 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28723-201ENSMUST00000188640 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm18699-201ENSMUST00000190713 243 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm19102-201ENSMUST00000201133 553 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm44033-201ENSMUST00000203699 695 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Prap1-201ENSMUST00000026540 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Svs3b-201ENSMUST00000063132 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Btg1-ps2-201ENSMUST00000089060 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Olfr444-201ENSMUST00000095955 1050 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Il1f5-201ENSMUST00000028360 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Myot-202ENSMUST00000115498 2087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Rbm6-ps1-201ENSMUST00000186192 2870 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Rdh1-201ENSMUST00000073639 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC7.75□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Trim12c-202ENSMUST00000130139 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Nsd2-203ENSMUST00000075812 7142 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Inca1-204ENSMUST00000108543 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm25000-201ENSMUST00000117016 114 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm17139-201ENSMUST00000163802 571 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Mir6940-201ENSMUST00000183447 70 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 1700029J03Rik-202ENSMUST00000189879 712 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Rnf4Q9QZS2 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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