Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Retreg1-205ENSMUST00000227275 3200 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Baz2b-201ENSMUST00000090925 7576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gphn-202ENSMUST00000110388 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm26012-201ENSMUST00000104411 128 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm11765-201ENSMUST00000121173 1205 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 2210420H20Rik-201ENSMUST00000188435 629 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm37214-201ENSMUST00000192860 916 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cbx3-ps4-201ENSMUST00000091531 549 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr73-201ENSMUST00000099838 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ube3c-204ENSMUST00000199032 3171 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Slc1a3-201ENSMUST00000005493 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Kif20a-202ENSMUST00000167161 3565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm36283-203ENSMUST00000220211 3732 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Bmx-202ENSMUST00000112265 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Wdr44-201ENSMUST00000035766 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Rpl35a-202ENSMUST00000115075 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Pinlyp-201ENSMUST00000011776 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Hmgn2-ps1-201ENSMUST00000120716 279 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm12001-201ENSMUST00000121727 913 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm16585-201ENSMUST00000161442 610 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm10182-201ENSMUST00000178676 273 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Il19-204ENSMUST00000187916 720 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-33-201ENSMUST00000193220 350 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm23927-202ENSMUST00000199928 216 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm45625-201ENSMUST00000209412 650 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC137127.2-201ENSMUST00000215086 935 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930555G21Rik-201ENSMUST00000221718 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 AC132468.1-201ENSMUST00000224706 499 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 4930553J12Rik-201ENSMUST00000023648 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 1700001C02Rik-201ENSMUST00000031078 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Uchl4-201ENSMUST00000039011 1162 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mill2-202ENSMUST00000072415 1075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm8394-201ENSMUST00000079684 952 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 2610028E06Rik-205ENSMUST00000156350 3623 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Icos-202ENSMUST00000102827 3241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mkl2-204ENSMUST00000149359 8295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms