Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC132239.1-201ENSMUST00000223157 773 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Wdfy3-201ENSMUST00000053177 14274 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Uggt1-201ENSMUST00000046875 9033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Serpinb1a-201ENSMUST00000076352 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Spata1-202ENSMUST00000093951 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Zfyve9-201ENSMUST00000042185 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ctnnd1-210ENSMUST00000111684 6021 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Nos1-202ENSMUST00000102557 4591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Mbnl2-201ENSMUST00000088419 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Upf3b-201ENSMUST00000076265 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm37570-201ENSMUST00000195411 3106 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Nrip1-202ENSMUST00000121927 7868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm12258-201ENSMUST00000093768 2524 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pcdh9-201ENSMUST00000068992 3714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm25757-201ENSMUST00000103986 123 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Cldn16-201ENSMUST00000115302 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm13828-201ENSMUST00000122278 363 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm13936-201ENSMUST00000130416 715 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm12590-201ENSMUST00000134226 404 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm29626-202ENSMUST00000191517 425 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 CT009733.1-202ENSMUST00000224941 441 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Wdr27-206ENSMUST00000228330 2759 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Vmn1r76-201ENSMUST00000058772 975 ntAPPRIS P2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr1360-201ENSMUST00000079135 980 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pde1c-205ENSMUST00000166102 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Smpd4-201ENSMUST00000006053 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pogk-203ENSMUST00000131487 8692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr1509-206ENSMUST00000215030 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm13403-201ENSMUST00000127936 3651 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Bdnf-210ENSMUST00000111051 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Kif9-202ENSMUST00000084952 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Iars-201ENSMUST00000047363 4396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Pogz-204ENSMUST00000107269 5966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Nln-201ENSMUST00000109315 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Iqch-206ENSMUST00000171243 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Atg3Q9CPX6 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms