Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Cep55-202ENSMUST00000116506 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Shq1Q7TMX5 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm10600-201ENSMUST00000117202 2047 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Zzef1-208ENSMUST00000207107 11306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cyp24a1-201ENSMUST00000038824 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Csf3r-202ENSMUST00000106162 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Vmn1r-ps123-201ENSMUST00000110449 237 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 1810041H14Rik-203ENSMUST00000187773 416 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm35520-201ENSMUST00000209235 784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rars-201ENSMUST00000018992 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Naip1-201ENSMUST00000022142 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 F630040K05Rik-201ENSMUST00000180519 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Stk38l-202ENSMUST00000111644 2274 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cobl-210ENSMUST00000174874 5451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Bivm-202ENSMUST00000114709 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 P2ry4-201ENSMUST00000053373 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm15704-201ENSMUST00000144757 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Matr3-215ENSMUST00000190121 2638 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm31181-201ENSMUST00000217731 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm13243-201ENSMUST00000117481 565 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 CT009527.2-201ENSMUST00000225386 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 AC133958.1-201ENSMUST00000227085 961 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 AC122459.3-201ENSMUST00000228508 1042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm17076-201ENSMUST00000165185 1401 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Lpin1-207ENSMUST00000222989 4103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Hdac4-202ENSMUST00000097644 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Lpcat2b-201ENSMUST00000166599 2782 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Dmrtc1a-203ENSMUST00000120808 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm23007-201ENSMUST00000158951 177 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm29129-201ENSMUST00000191121 659 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shq1Q7TMX5 Gm45100-201ENSMUST00000209153 391 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms