Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Mroh2b-201ENSMUST00000045736 4829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm37953-201ENSMUST00000195293 1884 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm37499-201ENSMUST00000194683 3478 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Vmn1r50-203ENSMUST00000226577 2240 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 2010110K18Rik-201ENSMUST00000181453 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Clasp2-207ENSMUST00000214522 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Tmprss11g-201ENSMUST00000134179 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm5113-201ENSMUST00000085668 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm19325-201ENSMUST00000186238 3382 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm13573-201ENSMUST00000116410 631 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm15154-201ENSMUST00000117590 366 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm11348-201ENSMUST00000118813 318 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm15062-201ENSMUST00000120567 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm13726-201ENSMUST00000121278 794 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm14170-201ENSMUST00000133751 331 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 1700003G18Rik-202ENSMUST00000150518 312 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm6205-201ENSMUST00000165424 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm2058-201ENSMUST00000178791 560 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Trav22-201ENSMUST00000198117 346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gngt1-201ENSMUST00000031673 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 A630001G21Rik-201ENSMUST00000064788 1353 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm16429-201ENSMUST00000179824 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Gm33533-201ENSMUST00000193853 1633 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
LcorQ6ZPI3 Olfr1497-202ENSMUST00000217384 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Spen-201ENSMUST00000078886 12082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 A730049H05Rik-201ENSMUST00000057977 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Zfp472-201ENSMUST00000039132 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Cdon-201ENSMUST00000042842 7213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Dgkh-204ENSMUST00000227767 3319 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Nip7-201ENSMUST00000034392 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm42837-201ENSMUST00000197071 2829 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm28231-201ENSMUST00000190118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm46123-201ENSMUST00000217447 6424 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm34297-201ENSMUST00000218569 1980 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Fam160a2-208ENSMUST00000179474 10853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm44746-201ENSMUST00000205565 1349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Ighj1-201ENSMUST00000103430 53 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
LcorQ6ZPI3 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.5 ms