Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18828-201ENSMUST00000180475 857 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm27353-201ENSMUST00000184712 122 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43782-201ENSMUST00000202790 229 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1486-ps1-201ENSMUST00000208835 220 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm39456-201ENSMUST00000214759 1019 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm33091-201ENSMUST00000217798 748 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18955-201ENSMUST00000223173 649 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mif-ps7-201ENSMUST00000223357 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC164116.2-201ENSMUST00000225398 1038 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vmn1r233-201ENSMUST00000056339 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1160-201ENSMUST00000099839 960 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfyve16-201ENSMUST00000022217 6150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AY702103-202ENSMUST00000180996 5876 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ugt2a3-201ENSMUST00000031195 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43621-201ENSMUST00000202733 2022 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Nrg4-213ENSMUST00000164721 1927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 AC156273.1-201ENSMUST00000214570 2762 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cd101-202ENSMUST00000167086 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Slc2a3-201ENSMUST00000032476 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp667-205ENSMUST00000170776 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 H2-M10.6-201ENSMUST00000041398 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 H2-M10.5-201ENSMUST00000041531 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ttc39c-204ENSMUST00000169401 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm24665-201ENSMUST00000104160 129 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm15185-201ENSMUST00000117397 746 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm11406-201ENSMUST00000117418 484 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm3931-201ENSMUST00000119038 455 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm14800-201ENSMUST00000122084 1272 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm22811-201ENSMUST00000157468 154 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1381-201ENSMUST00000167248 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18709-201ENSMUST00000180564 489 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm18183-201ENSMUST00000191024 615 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28060-201ENSMUST00000191554 189 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm42945-202ENSMUST00000197523 537 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm43129-201ENSMUST00000201237 603 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 0610005C13Rik-211ENSMUST00000211530 402 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm45712-201ENSMUST00000212417 335 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1402-201ENSMUST00000060912 963 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Olfr1333-201ENSMUST00000076019 954 ntAPPRIS P2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sult2a3-201ENSMUST00000098809 1018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gpr55-201ENSMUST00000086975 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Plekha8-201ENSMUST00000101385 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 4930402H05Rik-201ENSMUST00000203115 2829 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Vps8-203ENSMUST00000115397 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Sin3a-207ENSMUST00000168502 4899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 G430049J08Rik-201ENSMUST00000179907 2686 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Unc93a-201ENSMUST00000084966 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Lca5-201ENSMUST00000034791 4160 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Fbxl2-201ENSMUST00000035090 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm26703-202ENSMUST00000181506 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tmx2-201ENSMUST00000053664 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms