Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC170188.1-201ENSMUST00000223710 1963 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cyp4v3-201ENSMUST00000095328 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pcdh15-216ENSMUST00000131724 6322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Scn3b-201ENSMUST00000049941 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Kirrel3-206ENSMUST00000187625 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Prkcz-202ENSMUST00000103178 4083 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Nol12-203ENSMUST00000138880 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Dgkg-202ENSMUST00000089925 3555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Kcnma1-206ENSMUST00000163322 3162 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Kcnma1-210ENSMUST00000179836 3177 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm9776-201ENSMUST00000059598 2980 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tirap-201ENSMUST00000175765 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rreb1-201ENSMUST00000037232 8395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Mpdz-201ENSMUST00000102830 7512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm36757-201ENSMUST00000221818 3556 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr958-202ENSMUST00000215505 3514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Efcab6-207ENSMUST00000156187 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 5330417C22Rik-201ENSMUST00000048012 3321 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Acly-207ENSMUST00000165111 4162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm14414-201ENSMUST00000120833 573 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Snhg12-203ENSMUST00000128131 614 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm27001-201ENSMUST00000182252 936 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm37433-201ENSMUST00000192695 678 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm37920-201ENSMUST00000192952 749 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm37441-201ENSMUST00000194430 678 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Slamf6-204ENSMUST00000194561 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm44427-201ENSMUST00000204123 456 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm6909-201ENSMUST00000209825 989 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Spaca7-203ENSMUST00000210276 715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tmem69-201ENSMUST00000069674 974 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tex47-201ENSMUST00000088796 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr742-201ENSMUST00000089836 1120 ntAPPRIS P1 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Lgals8-207ENSMUST00000143693 2457 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rgs9-203ENSMUST00000106704 3464 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cpeb1os1-201ENSMUST00000207156 2112 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm43071-201ENSMUST00000197233 2032 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4933430I17Rik-201ENSMUST00000062145 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 2900026A02Rik-202ENSMUST00000211733 10238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1110015O18Rik-202ENSMUST00000183944 1533 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Hpd-201ENSMUST00000031398 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pum3-201ENSMUST00000076219 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ttc37-201ENSMUST00000091466 5381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pla2r1-201ENSMUST00000112525 7112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms