Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Lrrc8dos-201ENSMUST00000135958 586 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Defa-ps3-201ENSMUST00000142705 282 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm24899-201ENSMUST00000158892 73 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm16103-201ENSMUST00000163003 1279 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 9330179D12Rik-202ENSMUST00000180811 1001 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm17875-201ENSMUST00000216005 941 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zfp438-201ENSMUST00000063989 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr523-206ENSMUST00000216023 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Emsy-201ENSMUST00000038359 3564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cops2-203ENSMUST00000110463 3392 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Dyrk1a-201ENSMUST00000023614 5754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fcgr3-201ENSMUST00000164044 1347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Vmn2r105-201ENSMUST00000167382 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC107740.1-201ENSMUST00000216972 2401 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zp4-ps-201ENSMUST00000220980 1561 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 4930443O20Rik-201ENSMUST00000135659 1443 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Kcna2-203ENSMUST00000197470 4370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm23358-201ENSMUST00000103887 110 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ino80c-202ENSMUST00000125169 756 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26607-201ENSMUST00000180661 867 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28677-203ENSMUST00000187144 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cnih4-205ENSMUST00000193907 531 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm17835-201ENSMUST00000196870 499 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm43287-201ENSMUST00000197747 600 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm39059-201ENSMUST00000209160 424 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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