Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Rngtt-202ENSMUST00000108153 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Arhgap12-208ENSMUST00000182213 4162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pkd2l2-201ENSMUST00000014647 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC079245.1-201ENSMUST00000215680 1454 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cxcl9-201ENSMUST00000113093 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 BC051077-201ENSMUST00000181440 2044 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mas1-201ENSMUST00000089015 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr656-202ENSMUST00000215575 4091 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tprkb-201ENSMUST00000067137 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC121942.3-201ENSMUST00000225768 1436 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Haus2-203ENSMUST00000124187 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir683-2-201ENSMUST00000102099 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7645-201ENSMUST00000119008 788 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6706-201ENSMUST00000145087 318 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm12126-201ENSMUST00000147717 619 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm4287-201ENSMUST00000174329 585 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm21762-201ENSMUST00000177561 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mir683-1-201ENSMUST00000179371 109 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rpl28-ps2-201ENSMUST00000194739 554 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37371-201ENSMUST00000194837 392 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm43247-201ENSMUST00000198638 481 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm42529-201ENSMUST00000201843 741 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm6308-201ENSMUST00000203226 313 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm8667-201ENSMUST00000211112 449 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm32220-201ENSMUST00000218420 298 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm33682-201ENSMUST00000222233 256 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 CT030646.1-201ENSMUST00000225049 980 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Slurp1-201ENSMUST00000023261 567 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Cox8c-201ENSMUST00000053611 458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 1700024P04Rik-201ENSMUST00000054425 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm4871-201ENSMUST00000071421 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Tac1-201ENSMUST00000090679 980 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp780b-203ENSMUST00000205874 1907 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm14373-201ENSMUST00000122467 2158 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Nmnat1-202ENSMUST00000105693 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm9105-201ENSMUST00000120160 1398 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Mterf1a-201ENSMUST00000044746 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 3110009F21Rik-201ENSMUST00000223217 1625 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Rab7b-202ENSMUST00000064679 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 AU015836-202ENSMUST00000121565 2997 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Zfp729a-201ENSMUST00000012314 9455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Vpreb2P13373 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms