Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm14802-201ENSMUST00000121944 1885 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr370-202ENSMUST00000209408 4600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mlip-215ENSMUST00000185144 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm43948-201ENSMUST00000203474 2376 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm12273-201ENSMUST00000137418 1084 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm24347-201ENSMUST00000158711 142 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ceacam-ps1-201ENSMUST00000205380 794 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm45795-201ENSMUST00000211847 400 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC132474.3-201ENSMUST00000213244 383 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm34006-201ENSMUST00000213985 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Hsd11b1-201ENSMUST00000016338 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Usp40-201ENSMUST00000040783 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ggta1-205ENSMUST00000113002 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gabpb2-205ENSMUST00000136139 8661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Fam126b-202ENSMUST00000097724 4581 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10424-202ENSMUST00000201031 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Nadk-201ENSMUST00000030939 2946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm22900-201ENSMUST00000104538 130 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11951-201ENSMUST00000116005 431 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm8802-201ENSMUST00000118633 740 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm11901-201ENSMUST00000120412 437 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm22224-201ENSMUST00000157357 93 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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H2-Eb1P04230 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm37247-201ENSMUST00000192549 730 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm4259-201ENSMUST00000206489 758 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm44508-201ENSMUST00000206943 1157 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr696-ps1-201ENSMUST00000207160 948 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm39329-201ENSMUST00000215849 798 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr139-201ENSMUST00000050678 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm25259-201ENSMUST00000083048 193 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Cdh8-203ENSMUST00000128860 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm14540-201ENSMUST00000138298 3261 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Sox6-205ENSMUST00000169129 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Bdnf-204ENSMUST00000111044 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
H2-Eb1P04230 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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