Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Synj2-201ENSMUST00000061091 4072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Dusp3-201ENSMUST00000003612 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm29435-201ENSMUST00000191310 689 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm32515-201ENSMUST00000219396 350 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Wdr48-201ENSMUST00000036561 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tpx2-202ENSMUST00000109816 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Arhgap32-206ENSMUST00000182802 5621 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trio-210ENSMUST00000227337 6375 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC159624.1-201ENSMUST00000217762 1344 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trmt10b-201ENSMUST00000044673 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm14009-201ENSMUST00000152439 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Snhg5-201ENSMUST00000180563 1004 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm29214-201ENSMUST00000190216 570 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm43203-201ENSMUST00000200130 558 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm46311-201ENSMUST00000217971 203 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 4930520K02Rik-201ENSMUST00000219522 388 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tbc1d7-204ENSMUST00000220787 892 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Nolc1-203ENSMUST00000223728 3523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC124450.1-201ENSMUST00000225569 495 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tmem164-203ENSMUST00000112888 4221 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trpm1-218ENSMUST00000206277 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Nup210l-202ENSMUST00000200410 5710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm37483-201ENSMUST00000194382 1484 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 BC016579-201ENSMUST00000036732 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 C5ar2-201ENSMUST00000098792 3429 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Samd3-206ENSMUST00000220219 1744 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cox7c-204ENSMUST00000132233 709 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Pla2g2a-203ENSMUST00000135748 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm15133-201ENSMUST00000139019 843 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm26587-201ENSMUST00000180795 989 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm29759-201ENSMUST00000205860 327 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm8275-201ENSMUST00000219732 424 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC106830.2-201ENSMUST00000226624 943 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 AC131029.2-203ENSMUST00000228116 1244 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ppfia2-201ENSMUST00000029404 5429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Esrrg-201ENSMUST00000027906 5293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 9530053A07Rik-201ENSMUST00000059886 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Trim2-202ENSMUST00000065380 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Grip1-213ENSMUST00000147454 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Musk-207ENSMUST00000177951 3352 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Musk-204ENSMUST00000098059 3352 ntTSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
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