Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm17977-201ENSMUST00000198743 574 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm42884-201ENSMUST00000200729 422 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm3774-201ENSMUST00000209773 435 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr180-203ENSMUST00000206168 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15283-201ENSMUST00000125308 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Galnt7-202ENSMUST00000110316 3413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 C1s1-204ENSMUST00000162443 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Dcx-203ENSMUST00000112851 4095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15318-202ENSMUST00000146320 1661 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Exoc1-202ENSMUST00000087133 3371 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Glrx-204ENSMUST00000223120 1333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Sox5-201ENSMUST00000038815 7243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 5430401H09Rik-202ENSMUST00000218836 2620 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Zfp207-203ENSMUST00000108216 2152 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Adgrl3-206ENSMUST00000118034 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Vcan-206ENSMUST00000159910 8332 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15539-201ENSMUST00000118452 566 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Rps18-ps1-201ENSMUST00000120838 459 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm11760-201ENSMUST00000122355 796 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 4930533D04Rik-201ENSMUST00000185478 788 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Igkv8-22-201ENSMUST00000199501 367 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Rpl18a-ps4-201ENSMUST00000206176 536 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC102312.1-202ENSMUST00000218600 851 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Nme7-201ENSMUST00000086028 834 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Antxrl-201ENSMUST00000058725 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43161-201ENSMUST00000197020 1688 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm14762-202ENSMUST00000122953 1430 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 2310069B03Rik-202ENSMUST00000186147 1833 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc22a26-201ENSMUST00000065634 2007 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Glyat-201ENSMUST00000044976 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pdzd9-201ENSMUST00000033178 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Rc3h1-202ENSMUST00000161609 11006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnft1Q9DCN7 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms