Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn2r96-202ENSMUST00000177244 1995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Stmn2-201ENSMUST00000029002 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ints10-202ENSMUST00000070713 4192 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr704-201ENSMUST00000080925 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Fam19a3-201ENSMUST00000139783 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Serpina3i-201ENSMUST00000109958 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm37060-201ENSMUST00000194997 2397 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Usp3-202ENSMUST00000098613 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Slc18b1-201ENSMUST00000119597 2837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ndrg1-201ENSMUST00000005256 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC136986.2-201ENSMUST00000220880 2944 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Pex5l-205ENSMUST00000108225 3109 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Ptges-202ENSMUST00000102852 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 1700020I14Rik-202ENSMUST00000153581 8300 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cwc22-205ENSMUST00000111824 2603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15217-201ENSMUST00000111826 733 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Spp1-205ENSMUST00000112748 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm14056-201ENSMUST00000117198 642 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm12385-201ENSMUST00000117439 795 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm11695-201ENSMUST00000144230 407 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 4933403O08Rik-202ENSMUST00000152343 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Dnajc28-204ENSMUST00000169982 3535 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm33994-201ENSMUST00000193724 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Klk1b14-ps-201ENSMUST00000206059 777 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Nucb1-210ENSMUST00000211765 4853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gm6869-201ENSMUST00000220334 734 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC164297.4-201ENSMUST00000224225 1307 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Tssk4-207ENSMUST00000228395 1273 ntAPPRIS P5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Mettl6-209ENSMUST00000228727 2388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 AC122877.1-201ENSMUST00000228873 218 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Gpihbp1-201ENSMUST00000023243 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Klrb1b-201ENSMUST00000032472 2228 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Rbm25-201ENSMUST00000048155 4226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Magea2-201ENSMUST00000069477 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Clcn1Q64347 Olfr1219-202ENSMUST00000213724 5669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mast2-202ENSMUST00000106484 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Frk-202ENSMUST00000170771 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Trim21-202ENSMUST00000106913 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Snhg14-206ENSMUST00000187666 2517 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Tbc1d24-204ENSMUST00000167791 4383 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Myo15-202ENSMUST00000081823 7953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Exoc1-203ENSMUST00000113493 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gabrq-202ENSMUST00000114553 4943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Kng2-201ENSMUST00000039338 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28081-201ENSMUST00000185321 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29473-201ENSMUST00000185588 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28813-201ENSMUST00000186293 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28475-201ENSMUST00000187645 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29324-202ENSMUST00000188242 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29450-201ENSMUST00000189657 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29278-202ENSMUST00000189701 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm29381-201ENSMUST00000190168 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm28259-201ENSMUST00000190319 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm3822-201ENSMUST00000201941 2935 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Psmd10-202ENSMUST00000112978 1390 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Clcn1Q64347 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms