Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 Gm18808-201ENSMUST00000173316 462 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm43546-201ENSMUST00000196721 943 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm42713-201ENSMUST00000202709 945 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Klrb1-ps1-202ENSMUST00000203057 414 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm45136-201ENSMUST00000205793 943 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Ccdc18Q640L5 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Gm15991-201ENSMUST00000127631 942 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccdc18Q640L5 Gm6558-202ENSMUST00000192046 180 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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