Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

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Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Ms4a6b-205ENSMUST00000163078 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 R3hdm2-203ENSMUST00000105249 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm6044-201ENSMUST00000121819 499 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm4886-201ENSMUST00000121874 1176 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm14847-201ENSMUST00000121978 519 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm12440-201ENSMUST00000155224 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 U2af1l4-205ENSMUST00000163482 668 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Rd3l-201ENSMUST00000170525 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Sox5-204ENSMUST00000111748 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gbp11-202ENSMUST00000171587 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm45887-201ENSMUST00000212672 2998 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Chrna1-201ENSMUST00000028515 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm7842-201ENSMUST00000217691 1379 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Atf7ip-201ENSMUST00000032335 8059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Unc13d-201ENSMUST00000075036 3967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 6820431F20Rik-202ENSMUST00000153748 4659 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gpatch11-201ENSMUST00000170759 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Arsg-203ENSMUST00000106697 3232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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AtmQ62388 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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AtmQ62388 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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AtmQ62388 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gramd1c-202ENSMUST00000114677 3271 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 AC154347.1-201ENSMUST00000221358 3105 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm26656-201ENSMUST00000181825 2972 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 AC124184.1-201ENSMUST00000218167 283 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 CT030657.2-201ENSMUST00000220710 792 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
AtmQ62388 Htr4-201ENSMUST00000027560 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
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