Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Cab39l-206ENSMUST00000225595 1380 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Arhgef38-203ENSMUST00000161022 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rnf141-204ENSMUST00000175981 2333 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Anxa10-201ENSMUST00000034052 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Olfr987-202ENSMUST00000111598 1418 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Cacna1d-201ENSMUST00000112249 8068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Etohd2-201ENSMUST00000162450 4862 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Gm43890-201ENSMUST00000203437 2799 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Rab3gap1-207ENSMUST00000212506 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Znf48Q3US17 Pidd1-201ENSMUST00000026580 3357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ighv1-72-201ENSMUST00000103541 396 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Mfap5-202ENSMUST00000118626 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12875-201ENSMUST00000118745 344 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12508-201ENSMUST00000121282 480 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 E330017L17Rik-202ENSMUST00000139190 861 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm11832-201ENSMUST00000148576 432 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Prss28-201ENSMUST00000015267 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm20540-201ENSMUST00000172972 799 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700116B05Rik-201ENSMUST00000173461 414 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm22649-201ENSMUST00000175134 298 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm20655-201ENSMUST00000176132 473 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Fam47e-207ENSMUST00000176621 746 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm20717-201ENSMUST00000176762 657 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700011B04Rik-201ENSMUST00000189140 651 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1348-204ENSMUST00000208066 1135 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 1700008N11Rik-201ENSMUST00000209848 636 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm7965-201ENSMUST00000211675 1105 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cx3cl1-206ENSMUST00000211956 470 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm45788-201ENSMUST00000212210 584 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr878-202ENSMUST00000212878 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm9662-201ENSMUST00000216748 1206 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC117245.2-201ENSMUST00000216943 570 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 4930525C09Rik-201ENSMUST00000217919 677 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC125488.2-201ENSMUST00000218908 793 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm32023-201ENSMUST00000220168 661 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC134869.4-201ENSMUST00000224724 609 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Vmn1r191-201ENSMUST00000072369 897 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 H2-M9-201ENSMUST00000087165 1125 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm10697-201ENSMUST00000091692 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Folr2-201ENSMUST00000094141 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Tdpoz5-201ENSMUST00000098879 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Spire1-207ENSMUST00000224799 2059 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rerg-201ENSMUST00000032347 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Sdr42e1-201ENSMUST00000037955 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 C330007P06Rik-201ENSMUST00000047486 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Fam169a-201ENSMUST00000042517 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm10101-202ENSMUST00000181311 2919 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rnasel-201ENSMUST00000086209 2938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm10447-201ENSMUST00000084653 2307 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC159301.1-202ENSMUST00000225860 2133 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm16063-201ENSMUST00000156235 1701 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Rassf9-201ENSMUST00000055355 1526 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 C920021L13Rik-202ENSMUST00000142433 1330 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Arpp21-221ENSMUST00000162065 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Cltc-202ENSMUST00000103186 6519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Gm42397-206ENSMUST00000208808 1358 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 9630002D21Rik-201ENSMUST00000221128 1351 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 AI427809-203ENSMUST00000123127 2033 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Znf48Q3US17 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms