Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1389-201ENSMUST00000203369 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 4930425L21Rik-201ENSMUST00000203439 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr97-204ENSMUST00000214622 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 AC153968.1-201ENSMUST00000215584 334 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gja10-202ENSMUST00000219644 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc3b-203ENSMUST00000223700 1426 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Otoa-201ENSMUST00000047025 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr159-201ENSMUST00000053931 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 A930002I21Rik-201ENSMUST00000060946 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr97-201ENSMUST00000073667 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef9-209ENSMUST00000181987 6222 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rxfp1-201ENSMUST00000078527 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Slco2b1-203ENSMUST00000107088 4369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Nrf1-204ENSMUST00000115199 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Med1-201ENSMUST00000018304 5845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm973-201ENSMUST00000114243 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tlr5-201ENSMUST00000110997 3199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Triml2-204ENSMUST00000210136 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb44-202ENSMUST00000167346 1308 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Vamp7-ps-201ENSMUST00000120334 655 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm11609-201ENSMUST00000121926 793 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Tmem216-205ENSMUST00000145210 774 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm43434-201ENSMUST00000196615 676 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 AC151967.1-201ENSMUST00000198146 76 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm44258-201ENSMUST00000204925 301 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Vnn1-201ENSMUST00000041416 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Sez6l2-202ENSMUST00000106333 3595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Sec16b-201ENSMUST00000027881 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm28187-201ENSMUST00000186885 2134 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Trpc4-205ENSMUST00000200048 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Ube2l3-202ENSMUST00000115699 2906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm42868-201ENSMUST00000199168 2697 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd36-206ENSMUST00000197890 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Sept14-203ENSMUST00000182386 1642 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Slc12a8-201ENSMUST00000059056 3166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 AC120425.1-201ENSMUST00000225213 2360 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Olfr650-ps1-201ENSMUST00000121432 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd300a-201ENSMUST00000045151 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Dnase1l1-202ENSMUST00000075821 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 AC132596.1-201ENSMUST00000223043 2263 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd36-201ENSMUST00000082367 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Etfdh-202ENSMUST00000120992 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Syt17-201ENSMUST00000081574 2764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Samd15-202ENSMUST00000182869 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm13750-201ENSMUST00000117621 465 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm23430-201ENSMUST00000122490 314 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Crip3-206ENSMUST00000165993 735 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm18501-201ENSMUST00000185363 664 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm43048-201ENSMUST00000196101 388 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm43388-201ENSMUST00000197818 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm31172-201ENSMUST00000210068 321 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sf3b2Q3UJB0 Gm6581-201ENSMUST00000214545 260 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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