Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Rtl3-201ENSMUST00000062010 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Htr1d-201ENSMUST00000088677 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Olfr1246-202ENSMUST00000213221 5338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Olfr1246-203ENSMUST00000217192 5301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ndp-201ENSMUST00000040134 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Adamts6-201ENSMUST00000065766 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm11443-201ENSMUST00000118790 479 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Tph1-205ENSMUST00000168335 578 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Mir7005-201ENSMUST00000185089 69 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Kcne3-205ENSMUST00000207358 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm19056-201ENSMUST00000218220 797 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Hba-a2-201ENSMUST00000093207 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ncam1-204ENSMUST00000193547 6050 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Wdfy4-202ENSMUST00000130509 10158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ralgps2-204ENSMUST00000172057 6863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Dnajc6-203ENSMUST00000106929 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm37618-201ENSMUST00000192891 3075 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Fbxo32-201ENSMUST00000022986 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm10376-201ENSMUST00000100694 555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Igkv9-123-201ENSMUST00000103313 377 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm28142-201ENSMUST00000186899 698 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm29107-201ENSMUST00000190910 347 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm18428-201ENSMUST00000194986 791 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm43040-201ENSMUST00000202399 558 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm8921-201ENSMUST00000204306 649 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 9330102E08Rik-201ENSMUST00000204642 3843 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Plb1-206ENSMUST00000202220 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Znfx1-202ENSMUST00000067584 4147 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm42576-201ENSMUST00000202336 2846 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Ccdc39-201ENSMUST00000029222 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Olfr522-201ENSMUST00000050585 4766 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Siah1bQ06985 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms