Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm7436-201ENSMUST00000187229 391 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm9451-201ENSMUST00000188491 604 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm28239-201ENSMUST00000190225 447 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm16754-202ENSMUST00000193429 508 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm40319-201ENSMUST00000199785 481 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm42813-201ENSMUST00000200057 615 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm42887-201ENSMUST00000202469 1119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rtp4-203ENSMUST00000210901 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC160635.1-201ENSMUST00000216731 474 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm3776-201ENSMUST00000217203 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm9110-201ENSMUST00000219035 617 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 CT009546.3-201ENSMUST00000220914 208 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AC122309.1-201ENSMUST00000226945 421 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr1312-202ENSMUST00000213582 2891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cd44-206ENSMUST00000111192 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Psg22-202ENSMUST00000108481 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Psg22-203ENSMUST00000208221 1871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Psg22-201ENSMUST00000051973 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm14244-201ENSMUST00000155688 2410 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Mrpl17-202ENSMUST00000124482 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 1700031F05Rik-201ENSMUST00000048061 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Mab21l3-201ENSMUST00000061831 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cd44-204ENSMUST00000111190 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 1810018F18Rik-202ENSMUST00000189546 1447 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Lilrb4a-203ENSMUST00000219696 1441 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Krr1-203ENSMUST00000163048 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rnf24-202ENSMUST00000110194 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Tm4sf1-202ENSMUST00000171384 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Atp2b4-207ENSMUST00000165602 8101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Scn8a-204ENSMUST00000108909 11436 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Vmn1r52-203ENSMUST00000227100 2307 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ogdhl-203ENSMUST00000228529 3723 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Acp1-201ENSMUST00000062740 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm37510-201ENSMUST00000194151 4762 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rapgef4-202ENSMUST00000090826 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Srpk2-201ENSMUST00000088392 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Dram2-203ENSMUST00000121034 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Pik3r3-201ENSMUST00000030464 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Zc2hc1c-201ENSMUST00000059341 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Plxna2-201ENSMUST00000027952 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm9493-201ENSMUST00000104916 579 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm16221-201ENSMUST00000117331 393 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Vmn1r-ps103-201ENSMUST00000120171 893 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rps16-ps2-201ENSMUST00000140155 441 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Klra13-ps-202ENSMUST00000144414 769 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Rps29P62274 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms