Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 4930512H18Rik-201ENSMUST00000133752 1493 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ighv1-82-201ENSMUST00000103549 294 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Prr13-202ENSMUST00000164688 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 1700071M16Rik-202ENSMUST00000167672 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm43351-201ENSMUST00000198737 326 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zc2hc1b-201ENSMUST00000019954 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm7839-201ENSMUST00000210755 673 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm45834-201ENSMUST00000212445 454 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tcl1b3-201ENSMUST00000090990 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Tnik-203ENSMUST00000159680 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm28068-201ENSMUST00000190861 3503 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-201ENSMUST00000041717 3590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Rufy3-201ENSMUST00000031229 4049 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gmeb1-203ENSMUST00000105965 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm2721-202ENSMUST00000222652 459 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tarm1-201ENSMUST00000065703 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Ocm-202ENSMUST00000085704 330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm37541-201ENSMUST00000192464 2315 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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