Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm9378-201ENSMUST00000120315 471 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12402-201ENSMUST00000120536 334 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Prlr-204ENSMUST00000128450 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm15857-201ENSMUST00000133476 789 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12514-201ENSMUST00000142782 568 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13269-201ENSMUST00000143458 655 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm16116-201ENSMUST00000159472 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr270-202ENSMUST00000172257 939 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm18970-201ENSMUST00000186040 938 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm6750-201ENSMUST00000189273 268 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm28548-201ENSMUST00000191599 409 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42952-206ENSMUST00000199324 506 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC107663.2-201ENSMUST00000225534 1234 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Adgre1-202ENSMUST00000086763 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44797-201ENSMUST00000208780 1837 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm35722-201ENSMUST00000218270 1625 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Stard9-201ENSMUST00000070420 4874 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1564-204ENSMUST00000213751 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RxraP28700 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RxraP28700 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1006-201ENSMUST00000099917 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Dusp18-201ENSMUST00000055931 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1320-203ENSMUST00000214375 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Npr3-204ENSMUST00000228489 1969 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm22271-201ENSMUST00000104035 128 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm14519-201ENSMUST00000118490 312 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Myl1-202ENSMUST00000119429 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27288-201ENSMUST00000184215 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27597-201ENSMUST00000184365 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mir6912-201ENSMUST00000184456 70 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27506-201ENSMUST00000184558 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27529-201ENSMUST00000184975 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm27907-201ENSMUST00000185101 80 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC153500.1-201ENSMUST00000219794 625 ntTSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm32089-201ENSMUST00000221222 1193 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Ube2e2-201ENSMUST00000076133 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1226-201ENSMUST00000099790 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 5530400K19Rik-201ENSMUST00000193511 1916 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cyp2c53-ps-202ENSMUST00000175960 1370 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm17300-201ENSMUST00000172202 1527 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
RxraP28700 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
RxraP28700 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms