Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Rpl27a-ps1-201ENSMUST00000075382 448 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Gm25926-201ENSMUST00000082899 160 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Impa1-201ENSMUST00000065938 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Lipt1-201ENSMUST00000041621 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Cdc42bpa-218ENSMUST00000212756 5247 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Star-201ENSMUST00000033979 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Olfr1315-ps1-203ENSMUST00000217078 1559 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 C1qtnf7-201ENSMUST00000076939 3879 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Eif3aP23116 Gm16638-202ENSMUST00000208892 8508 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Igkv4-80-201ENSMUST00000103341 348 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm14329-201ENSMUST00000136027 591 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Hist2h2bb-201ENSMUST00000177113 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm38203-201ENSMUST00000191815 245 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm6767-201ENSMUST00000118650 1381 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 BC106179-201ENSMUST00000055369 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 AC132412.1-201ENSMUST00000204155 2724 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm24130-201ENSMUST00000158536 151 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm20430-201ENSMUST00000172474 207 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 4930526L06Rik-201ENSMUST00000181137 1022 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 1700016D06Rik-202ENSMUST00000190741 604 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm18765-201ENSMUST00000203166 660 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm45309-201ENSMUST00000211528 695 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Thyn1-203ENSMUST00000213770 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 AC118249.1-201ENSMUST00000224822 608 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Cthrc1-204ENSMUST00000226433 596 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gng2-201ENSMUST00000055100 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm26856-201ENSMUST00000181919 1349 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Olfr1346-202ENSMUST00000207658 4429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Ctsc-203ENSMUST00000131108 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Masp2-201ENSMUST00000052060 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm37956-201ENSMUST00000195208 2010 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Aqp9-203ENSMUST00000113570 1712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm5402-201ENSMUST00000119588 1618 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm22152-201ENSMUST00000116966 125 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm13988-201ENSMUST00000119363 288 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Eif3aP23116 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms