Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm42441-201ENSMUST00000199778 748 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Oaz3-206ENSMUST00000204548 787 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC156561.1-201ENSMUST00000224774 233 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC160109.1-201ENSMUST00000225592 729 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC140406.3-201ENSMUST00000227619 478 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC163295.2-202ENSMUST00000227763 1053 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tff3-201ENSMUST00000024827 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm10134-201ENSMUST00000074761 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rps25-201ENSMUST00000080300 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmem241-203ENSMUST00000092075 595 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Spin4-201ENSMUST00000096367 4173 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cfap221-202ENSMUST00000174370 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37309-201ENSMUST00000194994 1639 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm4319-201ENSMUST00000191139 2048 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Grik2-202ENSMUST00000105484 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Neurod1-201ENSMUST00000041099 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933400F21Rik-203ENSMUST00000187295 2633 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmcc3-203ENSMUST00000117929 3317 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28583-201ENSMUST00000188903 2141 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9048-201ENSMUST00000177744 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9040-201ENSMUST00000177762 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9044-201ENSMUST00000179851 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9046-201ENSMUST00000218329 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Smarcal1-201ENSMUST00000047615 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm1698-201ENSMUST00000136749 2313 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Arhgap6-202ENSMUST00000087016 1310 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Prb1-201ENSMUST00000087853 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ifna13-201ENSMUST00000105149 819 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr639-201ENSMUST00000106862 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14419-201ENSMUST00000108975 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12250-201ENSMUST00000119467 1274 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933406K04Rik-201ENSMUST00000124068 1136 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13049-201ENSMUST00000133196 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11999-201ENSMUST00000145789 813 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm24748-201ENSMUST00000157836 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm16301-201ENSMUST00000161959 295 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rsrc1-209ENSMUST00000162693 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20447-201ENSMUST00000173290 599 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm8257-203ENSMUST00000179215 489 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mir124-2hg-205ENSMUST00000189467 173 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43952-201ENSMUST00000203765 751 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5037-201ENSMUST00000205327 618 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 B230311B06Rik-202ENSMUST00000207610 687 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm36843-201ENSMUST00000209303 627 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm45346-201ENSMUST00000209925 1273 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7850-201ENSMUST00000212909 712 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dppa5b-201ENSMUST00000214261 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC134607.1-201ENSMUST00000214707 485 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dppa5c-201ENSMUST00000216268 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933404K13Rik-203ENSMUST00000217125 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms