Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC122829.1-201ENSMUST00000219743 1631 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 1110019D14Rik-202ENSMUST00000181225 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr845-203ENSMUST00000215572 3446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm25502-201ENSMUST00000104428 131 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm23368-201ENSMUST00000116939 96 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm6136-201ENSMUST00000120149 891 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Rpl21-ps8-201ENSMUST00000130005 478 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm6851-201ENSMUST00000154478 395 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Gm18822-201ENSMUST00000182857 1025 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm29168-201ENSMUST00000189953 687 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1398-ps1-201ENSMUST00000193866 929 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm8850-201ENSMUST00000195316 588 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm45394-201ENSMUST00000209240 1175 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 1600027J07Rik-201ENSMUST00000209501 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm21941-201ENSMUST00000221121 562 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Snora74a-201ENSMUST00000083715 196 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Gm7027-201ENSMUST00000086958 862 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Olfr1179-201ENSMUST00000099825 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm6999-201ENSMUST00000180427 2658 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Grip1-208ENSMUST00000138410 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Heatr1-201ENSMUST00000059270 6780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Afap1l2-203ENSMUST00000122359 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Mlip-212ENSMUST00000184848 1019 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm9729-201ENSMUST00000196364 265 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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Rnf4Q9QZS2 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm32842-201ENSMUST00000212653 738 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr24-201ENSMUST00000066997 1157 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr412-201ENSMUST00000077794 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Snora61-201ENSMUST00000083015 130 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm5614-201ENSMUST00000091097 318 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ceacam1-202ENSMUST00000098668 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ston2-201ENSMUST00000052969 9896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 AC159264.1-202ENSMUST00000224856 3162 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm35835-201ENSMUST00000214447 4589 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Ppfia2-203ENSMUST00000217854 8885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 Gm28856-201ENSMUST00000189150 2828 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
Rnf4Q9QZS2 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
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