Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Scgb2b30-201ENSMUST00000187013 336 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm5920-201ENSMUST00000187390 853 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Scgb2b10-201ENSMUST00000191403 318 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 2510016D11Rik-201ENSMUST00000201971 985 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm21048-201ENSMUST00000202470 1166 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 AC160413.1-201ENSMUST00000217909 932 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 AC171241.2-201ENSMUST00000228744 892 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Krtap13-1-201ENSMUST00000060494 748 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Mir30c-1-201ENSMUST00000083556 89 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Ceacam1-208ENSMUST00000206676 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Kat6b-209ENSMUST00000182964 7699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm35147-201ENSMUST00000208383 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Atp6ap2-201ENSMUST00000033313 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Daam1-205ENSMUST00000223272 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Myof-202ENSMUST00000172095 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm29222-201ENSMUST00000185442 2167 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm29449-201ENSMUST00000187820 2168 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 Gm28743-201ENSMUST00000189014 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm29384-201ENSMUST00000190852 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm37538-201ENSMUST00000192417 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 CT009536.1-201ENSMUST00000223774 2151 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 AC159476.1-201ENSMUST00000215914 1668 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 Ece2-207ENSMUST00000079600 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 Timm8b-201ENSMUST00000044051 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Ube3bQ9ES34 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gm10283-201ENSMUST00000093494 354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 A830010M20Rik-201ENSMUST00000060553 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Psg-ps1-201ENSMUST00000165490 1574 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 D3Ertd751e-208ENSMUST00000192193 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gpr85-203ENSMUST00000115492 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Lpin1-202ENSMUST00000111067 5433 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Arl6-201ENSMUST00000023405 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ube3bQ9ES34 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms