Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm46313-201ENSMUST00000220463 547 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Parp8-203ENSMUST00000223949 2965 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1330-201ENSMUST00000094830 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cd247-208ENSMUST00000178336 2807 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ermard-204ENSMUST00000097395 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Esrrg-202ENSMUST00000110938 5373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm29113-201ENSMUST00000185991 3432 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm5975-201ENSMUST00000185256 1399 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Grik2-204ENSMUST00000218441 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Coa7-202ENSMUST00000131656 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Asap1-215ENSMUST00000177035 3228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm8818-201ENSMUST00000110797 1047 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm4141-201ENSMUST00000174364 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm4201-201ENSMUST00000174775 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm3650-201ENSMUST00000180600 747 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Fendrr-201ENSMUST00000181231 1092 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Zfp493-203ENSMUST00000181319 730 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1700095A13Rik-201ENSMUST00000185460 711 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm29517-201ENSMUST00000190744 351 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 AC122774.1-201ENSMUST00000227703 762 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Bdh2-201ENSMUST00000029817 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6083-201ENSMUST00000075518 357 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc25a14-202ENSMUST00000114936 1582 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Bdnf-207ENSMUST00000111047 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pum1-203ENSMUST00000097864 4017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm44249-201ENSMUST00000204538 1805 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Cmah-201ENSMUST00000050859 2444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Mapk1ip1l-201ENSMUST00000164235 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm45832-201ENSMUST00000212762 1443 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Entpd3-201ENSMUST00000047687 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 1700010N08Rik-202ENSMUST00000188166 1323 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Etv1-201ENSMUST00000095767 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ighv2-4-201ENSMUST00000103447 350 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-56-201ENSMUST00000103527 294 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 n-R5s90-201ENSMUST00000103968 118 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm8832-201ENSMUST00000119890 395 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm11763-201ENSMUST00000119964 312 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm2214-201ENSMUST00000121333 330 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Fam187b-202ENSMUST00000128384 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rnft1Q9DCN7 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms