Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm14200-201ENSMUST00000122256 192 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm25770-201ENSMUST00000158566 115 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ang-ps1-201ENSMUST00000162314 436 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm26436-201ENSMUST00000180325 132 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 4933400F21Rik-201ENSMUST00000186098 1007 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 1700081B01Rik-202ENSMUST00000197543 648 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC159263.2-201ENSMUST00000221593 411 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC192334.3-201ENSMUST00000221828 569 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC137117.3-201ENSMUST00000226265 485 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Hist1h1t-201ENSMUST00000041052 912 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Prom1-204ENSMUST00000087442 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Sh3bgrl2-201ENSMUST00000113215 4565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm38331-201ENSMUST00000195719 2671 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Tcf7l2-210ENSMUST00000111657 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm37090-201ENSMUST00000195694 4105 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 7420700N18Rik-201ENSMUST00000209524 1644 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm12170-201ENSMUST00000119281 300 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm15009-201ENSMUST00000121387 322 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm18779-201ENSMUST00000173444 577 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm38226-201ENSMUST00000192207 521 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Zfp473-207ENSMUST00000149011 9230 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Gm36694-201ENSMUST00000205855 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
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Sh3bp1P55194 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Slitrk2-201ENSMUST00000036043 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Frmpd4-202ENSMUST00000112146 8153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Naa11-201ENSMUST00000060265 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Serpinb1c-201ENSMUST00000021834 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Sla-205ENSMUST00000168589 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Ttll6-201ENSMUST00000107680 3485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Zfp947-201ENSMUST00000080249 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Sh3bp1P55194 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
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