Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm46317-201ENSMUST00000221103 393 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm10805-201ENSMUST00000099710 399 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vma21-203ENSMUST00000114577 4652 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Smyd3-204ENSMUST00000128302 6871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zfp964-201ENSMUST00000169125 1416 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Trim16-201ENSMUST00000055006 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Hipk1-202ENSMUST00000106845 3967 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Wls-201ENSMUST00000068952 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr943-204ENSMUST00000213830 8305 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rag1-201ENSMUST00000078494 6608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Skp2-202ENSMUST00000110585 6185 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Map3k13-201ENSMUST00000042065 6709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Nfasc-202ENSMUST00000094569 9739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Srgap2-201ENSMUST00000097588 8026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm33035-201ENSMUST00000219854 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Trav9-2-201ENSMUST00000103654 563 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm22426-201ENSMUST00000103811 96 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Smim23-202ENSMUST00000109365 331 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15836-201ENSMUST00000119952 793 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm1947-201ENSMUST00000122451 910 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm29273-201ENSMUST00000188880 262 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm37857-201ENSMUST00000191784 1199 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm42538-201ENSMUST00000196233 566 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm5535-206ENSMUST00000210067 679 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm18192-201ENSMUST00000210174 941 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm45900-201ENSMUST00000211879 409 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rps25-205ENSMUST00000216867 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC165349.2-201ENSMUST00000219097 426 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm46323-201ENSMUST00000223136 628 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC099629.1-201ENSMUST00000226778 464 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Olfr328-201ENSMUST00000073933 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm20302-201ENSMUST00000080671 275 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vmn2r55-202ENSMUST00000172743 2346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC123832.1-201ENSMUST00000214120 2371 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Asxl2-202ENSMUST00000111215 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4932414J04Rik-201ENSMUST00000152483 3059 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4930447C04Rik-208ENSMUST00000136075 1970 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Zfp825-202ENSMUST00000202645 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm26920-201ENSMUST00000182746 2374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Mtif2-201ENSMUST00000020749 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Sptan1-202ENSMUST00000095083 7883 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Rab39b-201ENSMUST00000033545 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm11969-201ENSMUST00000118848 356 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm14376-201ENSMUST00000145297 297 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Tmigd3-204ENSMUST00000198080 832 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm45145-203ENSMUST00000208872 958 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 4930483O08Rik-201ENSMUST00000209850 1030 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
SrprbP47758 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms