Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Usp7-208ENSMUST00000161046 4003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm44437-201ENSMUST00000203832 4038 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Sema3d-205ENSMUST00000197927 3207 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm35572-201ENSMUST00000212427 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Obox3-201ENSMUST00000086122 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ccdc7a-201ENSMUST00000095158 1547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr654-203ENSMUST00000213984 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 3632451O06Rik-202ENSMUST00000118129 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr1198-202ENSMUST00000215179 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Zfp292-201ENSMUST00000047950 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Xlr5b-202ENSMUST00000114518 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Xlr5a-204ENSMUST00000179600 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tespa1-201ENSMUST00000042586 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Xlr5a-201ENSMUST00000078574 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pcdhb15-201ENSMUST00000050034 2801 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Stag3-201ENSMUST00000048028 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Extl2-201ENSMUST00000029575 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Foxp3-204ENSMUST00000115740 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm12310-201ENSMUST00000118013 492 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Scgb2b20-201ENSMUST00000179248 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm8151-201ENSMUST00000184817 871 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Mark1-ps3-201ENSMUST00000184922 694 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Scgb2b18-201ENSMUST00000186529 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Scgb2b11-201ENSMUST00000188293 523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Vmn1r-ps5-201ENSMUST00000202963 931 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm18060-201ENSMUST00000207407 564 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cenpn-205ENSMUST00000212775 837 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm8767-201ENSMUST00000215786 1070 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC158518.1-201ENSMUST00000216435 320 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC092710.1-201ENSMUST00000221005 192 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ulk4-201ENSMUST00000051479 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Hspbap1-201ENSMUST00000023555 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm20275-201ENSMUST00000215963 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Zfp958-201ENSMUST00000073201 1401 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Syt11-201ENSMUST00000090945 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Alkbh1-209ENSMUST00000162961 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Heatr5b-201ENSMUST00000097281 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Pot1a-209ENSMUST00000166445 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm39323-201ENSMUST00000215913 2942 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Rai14-201ENSMUST00000090339 4909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm26629-201ENSMUST00000180848 2276 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Prdm10-201ENSMUST00000074510 3408 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm10069-201ENSMUST00000144745 3694 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Trbv14-201ENSMUST00000103272 368 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm23946-201ENSMUST00000104423 197 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Cep112-204ENSMUST00000106724 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm12648-201ENSMUST00000126270 656 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Nedd1P33215 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms