Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rhox3g-201ENSMUST00000119965 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14186-201ENSMUST00000120804 137 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12163-201ENSMUST00000121597 389 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Fhad1os1-201ENSMUST00000146094 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm25837-201ENSMUST00000158919 108 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 A230009B12Rik-201ENSMUST00000159422 898 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm2541-201ENSMUST00000161209 711 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm8964-201ENSMUST00000165944 805 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4931429L15Rik-203ENSMUST00000172280 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Smarca2-213ENSMUST00000176698 955 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm42917-201ENSMUST00000200668 928 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm32916-201ENSMUST00000207884 935 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm43154-209ENSMUST00000209659 1165 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC124577.1-201ENSMUST00000214044 487 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4930477N07Rik-201ENSMUST00000218762 614 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC155269.1-201ENSMUST00000220843 769 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC158519.1-201ENSMUST00000228615 179 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Hba-a1-201ENSMUST00000093209 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1600012P17Rik-201ENSMUST00000062159 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm38416-201ENSMUST00000209648 3565 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Jakmip2-201ENSMUST00000082254 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmem41b-203ENSMUST00000119929 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14120-201ENSMUST00000129067 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lrtm1-201ENSMUST00000055662 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ms4a1-201ENSMUST00000169159 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zbbx-204ENSMUST00000107778 2467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm7086-201ENSMUST00000219083 1482 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Lrrc9-203ENSMUST00000161284 3817 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Il1f5-202ENSMUST00000114490 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cep192-201ENSMUST00000025425 8093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9436-201ENSMUST00000120949 1855 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Oxgr1-201ENSMUST00000058213 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmprss15-202ENSMUST00000060402 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mterf4-201ENSMUST00000027492 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm38276-201ENSMUST00000192446 1343 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm35028-201ENSMUST00000215400 2587 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Nox1-201ENSMUST00000033610 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Selenoi-203ENSMUST00000145167 6803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm25613-201ENSMUST00000104012 129 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Swi5-202ENSMUST00000113395 712 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gps2-203ENSMUST00000116358 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm14539-201ENSMUST00000117527 174 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Uqcc2-202ENSMUST00000118613 426 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm6275-201ENSMUST00000118971 1122 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12421-201ENSMUST00000119071 307 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13500-201ENSMUST00000119348 824 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 0610037L13Rik-206ENSMUST00000120473 835 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11897-201ENSMUST00000121976 828 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Fam229b-203ENSMUST00000125042 707 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm11399-201ENSMUST00000131021 324 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm13134-201ENSMUST00000132106 738 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Hk1os-203ENSMUST00000143122 1218 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Glipr1l2-202ENSMUST00000148897 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm24298-201ENSMUST00000158299 60 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Trp53-ps-201ENSMUST00000166597 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mir8100-201ENSMUST00000184230 121 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm27207-201ENSMUST00000184995 878 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms