Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm19815-201ENSMUST00000175818 335 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ighv5-5-201ENSMUST00000193826 329 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm42775-201ENSMUST00000198407 740 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Clec4n-201ENSMUST00000024118 1229 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 BC048671-201ENSMUST00000054799 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr101-201ENSMUST00000058046 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 3110035E14Rik-201ENSMUST00000088666 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Eapp-206ENSMUST00000163433 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cdh23-201ENSMUST00000073242 10688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Psg16-201ENSMUST00000071399 4421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1432-202ENSMUST00000207710 2068 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Klhl1-201ENSMUST00000022666 6645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26785-201ENSMUST00000181775 2914 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37326-201ENSMUST00000192828 3071 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Cep83os-201ENSMUST00000181906 6566 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr433-202ENSMUST00000214690 2968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37121-201ENSMUST00000192219 2556 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm36737-201ENSMUST00000209653 2189 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Sidt1-204ENSMUST00000127567 2901 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 F10-202ENSMUST00000063820 2503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Adgrg1-202ENSMUST00000179619 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slc16a14-201ENSMUST00000027422 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Fndc1-202ENSMUST00000097425 5845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 1700123O12Rik-202ENSMUST00000141312 660 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm13663-202ENSMUST00000145563 643 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm16540-201ENSMUST00000160263 426 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Arhgap26-218ENSMUST00000187912 312 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm5250-201ENSMUST00000059065 321 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Defb34-201ENSMUST00000064475 246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Olfr1243-201ENSMUST00000099775 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm26939-201ENSMUST00000177146 2261 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Inpp1-201ENSMUST00000027271 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Gm43684-201ENSMUST00000199279 6573 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Slf2-201ENSMUST00000096053 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
OtofQ9ESF1 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm8798-202ENSMUST00000213048 2357 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Ctxn3-201ENSMUST00000091892 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Mettl21e-201ENSMUST00000054801 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Myadm-204ENSMUST00000203566 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm43336-201ENSMUST00000200487 4504 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Map4k4-209ENSMUST00000192509 3918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm11865-201ENSMUST00000118093 859 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm14824-201ENSMUST00000119421 737 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Plet1-202ENSMUST00000188047 739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm38063-201ENSMUST00000193990 342 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
OtofQ9ESF1 Olfr680-ps1-201ENSMUST00000042676 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
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