Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Esrrg-203ENSMUST00000110939 4833 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Mrpl15-206ENSMUST00000156816 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Serpina1a-201ENSMUST00000072876 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Adgrl2-203ENSMUST00000168352 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm14343-201ENSMUST00000154524 731 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm29343-201ENSMUST00000187887 842 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm20063-201ENSMUST00000220757 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Trpv1-202ENSMUST00000102526 3361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Cherp-201ENSMUST00000079510 3713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Tcf23-201ENSMUST00000006818 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gsdmc3-201ENSMUST00000089894 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Pycard-201ENSMUST00000033056 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Mettl6-205ENSMUST00000227777 2762 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm29017-201ENSMUST00000190598 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Nrxn3-202ENSMUST00000110130 3654 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm29154-211ENSMUST00000213655 1499 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 4930551I15Rik-201ENSMUST00000219700 2143 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 C87436-202ENSMUST00000113698 2922 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Dab1-201ENSMUST00000106826 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm12518-201ENSMUST00000122075 779 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm12863-201ENSMUST00000155069 536 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Dap-202ENSMUST00000185618 388 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Platr10-201ENSMUST00000190602 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm7804-202ENSMUST00000194187 854 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Spcs2-203ENSMUST00000207137 881 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm42546-201ENSMUST00000201584 2592 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Tmem156-204ENSMUST00000212080 1411 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Arpp21-201ENSMUST00000035085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Pigr-201ENSMUST00000027675 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Nedd4-201ENSMUST00000034740 5499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Chrnb4-201ENSMUST00000034854 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Pde10a-201ENSMUST00000024647 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Ighv7-4-201ENSMUST00000103477 360 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm7019-201ENSMUST00000194122 369 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 1700094M23Rik-202ENSMUST00000198047 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm39075-201ENSMUST00000206031 512 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm6455-201ENSMUST00000095015 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Trcg1-201ENSMUST00000093837 2701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Rnf17Q99MV7 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms