Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ank2-201ENSMUST00000044443 5775 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm26896-201ENSMUST00000180482 2526 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Hipk1-203ENSMUST00000118317 7939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 AC164437.4-202ENSMUST00000228794 2413 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 A830036E02Rik-202ENSMUST00000128904 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cass4-202ENSMUST00000103073 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Kcnip4-204ENSMUST00000166924 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Tcf4-201ENSMUST00000066717 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1062-201ENSMUST00000105213 956 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12653-201ENSMUST00000117778 561 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm12903-201ENSMUST00000121015 544 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm14990-201ENSMUST00000122354 445 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 1700086P04Rik-201ENSMUST00000149472 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 1110038B12Rik-201ENSMUST00000172501 579 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm28807-201ENSMUST00000187799 471 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm43772-201ENSMUST00000202052 379 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 AC122273.1-202ENSMUST00000213884 695 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr1010-201ENSMUST00000216831 1270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 AC163342.1-201ENSMUST00000216533 2718 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 9930014A18Rik-202ENSMUST00000181910 4116 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Clasp1-221ENSMUST00000191823 3916 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cntrob-201ENSMUST00000092973 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Camk2d-205ENSMUST00000106401 3059 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 4831440D22Rik-201ENSMUST00000211287 2929 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm21719-202ENSMUST00000189073 1358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm25379-201ENSMUST00000104338 114 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm37260-201ENSMUST00000193748 1251 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Trav15n-2-201ENSMUST00000199112 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Trav15d-2-dv6d-2-201ENSMUST00000199800 398 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm33489-201ENSMUST00000223171 673 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Zfp827-201ENSMUST00000087927 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Gm26719-201ENSMUST00000180395 3220 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Rdh12-201ENSMUST00000021548 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Ccdc18Q640L5 Lctl-202ENSMUST00000118215 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm44280-201ENSMUST00000204498 3111 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Runx1t1-202ENSMUST00000098256 3317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Aph1b-201ENSMUST00000034934 4910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm10388-201ENSMUST00000205001 2936 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm15507-203ENSMUST00000140958 658 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm16098-201ENSMUST00000141926 796 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm8046-201ENSMUST00000172151 616 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm26505-201ENSMUST00000176208 166 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 AC069561.1-201ENSMUST00000213750 424 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ccnb1-202ENSMUST00000091295 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Lyn-202ENSMUST00000103010 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Meis2-205ENSMUST00000110907 3718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 B230364G03Rik-201ENSMUST00000181479 1374 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Cdh23-205ENSMUST00000105464 11090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Ptprb-203ENSMUST00000218553 7016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mrps5-201ENSMUST00000028852 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ccdc18Q640L5 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms