Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Lyrm7os-201ENSMUST00000154044 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sox5os3-202ENSMUST00000154167 765 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24912-201ENSMUST00000157291 117 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gpatch4-202ENSMUST00000166021 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Obox3-ps4-201ENSMUST00000176026 1005 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4930448I18Rik-201ENSMUST00000197958 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mrpl22-201ENSMUST00000020820 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4921515L22Rik-201ENSMUST00000218993 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4120-201ENSMUST00000220456 578 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18114-201ENSMUST00000221780 523 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 A930023M06Rik-201ENSMUST00000223270 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4933413J09Rik-201ENSMUST00000022427 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rpp14-201ENSMUST00000023924 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr78-202ENSMUST00000036557 3479 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfand1-201ENSMUST00000037839 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 1700063H04Rik-201ENSMUST00000043553 817 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Anpep-201ENSMUST00000049004 3422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4825-201ENSMUST00000079690 408 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mpo-201ENSMUST00000020779 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28775-201ENSMUST00000186918 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Fgd1-202ENSMUST00000112685 3240 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm46995-201ENSMUST00000223445 1378 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 C7-201ENSMUST00000110689 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm1322-201ENSMUST00000134620 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mymk-202ENSMUST00000163967 1210 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gstm5-204ENSMUST00000169365 810 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Scgb2b4-ps-201ENSMUST00000186705 340 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mrgprc7-ps-201ENSMUST00000187169 952 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Cfhr2-202ENSMUST00000194186 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rab25-201ENSMUST00000008745 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 1700126A01Rik-201ENSMUST00000185283 2061 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 A230001M10Rik-203ENSMUST00000198712 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Prdx1-204ENSMUST00000135573 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Srsf7-201ENSMUST00000063417 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 AC151904.1-201ENSMUST00000219945 1498 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gtpbp6Q3U6U5 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms