Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm38184-201ENSMUST00000195757 113 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir3107-201ENSMUST00000199351 90 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5723-201ENSMUST00000203096 432 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr573-ps1-202ENSMUST00000210571 894 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm45554-201ENSMUST00000210731 1004 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC134334.2-201ENSMUST00000214628 681 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm33929-201ENSMUST00000221762 367 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ccl17-201ENSMUST00000034232 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr49-201ENSMUST00000059996 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr867-201ENSMUST00000060780 996 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr573-ps1-201ENSMUST00000064830 888 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm17199-201ENSMUST00000097296 416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr549-201ENSMUST00000098227 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Arhgef3-201ENSMUST00000049206 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Tec-203ENSMUST00000113594 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Smok3b-201ENSMUST00000100537 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ces2g-201ENSMUST00000043183 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr641-202ENSMUST00000213214 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11870-201ENSMUST00000119255 1322 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Slc6a3-201ENSMUST00000022100 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm11548-201ENSMUST00000140203 2199 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Jam2-202ENSMUST00000114195 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Bves-201ENSMUST00000095715 4368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC113059.1-201ENSMUST00000181185 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cavin2-201ENSMUST00000051572 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
LtbrP50284 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gnl3l-202ENSMUST00000112691 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gnl3l-201ENSMUST00000026297 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Prdm2-201ENSMUST00000105778 7304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rnf214-209ENSMUST00000161203 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Bcas1-202ENSMUST00000068137 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cyp19a1-203ENSMUST00000215736 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Zscan18-205ENSMUST00000211392 3709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm13110-201ENSMUST00000138077 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Ccdc33-203ENSMUST00000098682 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Serpina1f-201ENSMUST00000021490 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cnep1r1-203ENSMUST00000121097 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm12046-201ENSMUST00000118536 331 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15241-201ENSMUST00000125700 474 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm14651-201ENSMUST00000147192 442 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26048-201ENSMUST00000157305 142 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Fxyd5-207ENSMUST00000161684 1172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm37450-201ENSMUST00000195218 170 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm26413-202ENSMUST00000198972 127 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19196-202ENSMUST00000210709 321 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm19196-203ENSMUST00000211164 363 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930555F03Rik-205ENSMUST00000212179 1257 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr209-204ENSMUST00000213779 564 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 4930568E12Rik-202ENSMUST00000216694 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Taf1b-203ENSMUST00000222710 521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 CT010475.1-201ENSMUST00000224753 526 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Olfr1276-201ENSMUST00000073322 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Vmn1r200-201ENSMUST00000074324 1063 ntAPPRIS P2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Lats2-203ENSMUST00000077981 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm22422-201ENSMUST00000083060 135 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gbp8-202ENSMUST00000112718 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gpr83-201ENSMUST00000034408 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 9330158H04Rik-208ENSMUST00000161820 2324 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Polr2l-201ENSMUST00000043870 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Sez6l2-203ENSMUST00000106335 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Hgd-203ENSMUST00000160847 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rabep1-204ENSMUST00000108533 2791 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Trpc7-202ENSMUST00000109871 3519 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
LtbrP50284 Cyp2c54-201ENSMUST00000048959 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms