Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Gm7954-201ENSMUST00000164967 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm8082-201ENSMUST00000165349 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm26561-201ENSMUST00000180743 1413 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 AC126028.1-201ENSMUST00000226218 2123 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TfamP40630 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Pgbd1-204ENSMUST00000148071 2600 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Kcnj15-205ENSMUST00000113858 5309 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Tspan8-203ENSMUST00000179196 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Smc1b-201ENSMUST00000023068 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Atxn7l1-201ENSMUST00000077456 1624 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Srl-202ENSMUST00000090500 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Dph6-202ENSMUST00000055144 2476 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm15989-201ENSMUST00000121895 498 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Mir7230-201ENSMUST00000195977 56 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 1700008B11Rik-201ENSMUST00000198145 634 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm44156-201ENSMUST00000203885 1189 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 A930014E10Rik-201ENSMUST00000205115 546 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Apoc1-204ENSMUST00000207978 339 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm45074-201ENSMUST00000209091 1240 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Golgb1-203ENSMUST00000114812 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm43670-201ENSMUST00000199047 1767 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 CU024890.1-201ENSMUST00000221361 2019 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Akap2-201ENSMUST00000043456 7211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Slc25a5-ps-203ENSMUST00000223928 1442 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm44187-201ENSMUST00000204735 1929 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Ttc38-203ENSMUST00000146088 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 AC151984.1-201ENSMUST00000218261 2976 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Eif4e2-202ENSMUST00000076362 3394 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm45194-202ENSMUST00000207962 1991 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TfamP40630 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm1976-202ENSMUST00000182639 1853 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm36380-201ENSMUST00000210339 4379 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 D030068K23Rik-204ENSMUST00000212085 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm28791-201ENSMUST00000185888 1779 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Dsc3-203ENSMUST00000225110 3123 ntAPPRIS P2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm43331-201ENSMUST00000197991 1689 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm28645-201ENSMUST00000185859 564 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm7560-201ENSMUST00000187748 873 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 4930449E01Rik-202ENSMUST00000188698 532 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm36961-201ENSMUST00000191980 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm42861-201ENSMUST00000199596 634 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 AC124585.1-201ENSMUST00000213334 953 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 1700018F24Rik-201ENSMUST00000031624 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Gm25129-201ENSMUST00000082651 133 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 A630095E13Rik-201ENSMUST00000093868 619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TfamP40630 Nsd2-204ENSMUST00000114397 5738 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.1 ms