Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Rpl22-ps1-201ENSMUST00000118652 386 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13494-201ENSMUST00000120828 1096 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13188-201ENSMUST00000121150 564 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm14425-201ENSMUST00000121240 606 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12989-201ENSMUST00000122331 731 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tmsb10-204ENSMUST00000144337 433 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12861-201ENSMUST00000145395 681 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm22207-201ENSMUST00000158609 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15841-201ENSMUST00000160540 517 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Prdx5-204ENSMUST00000173091 501 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mir5135-201ENSMUST00000174997 79 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Tcstv3-201ENSMUST00000178349 510 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Krtap22-2-201ENSMUST00000178913 380 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm23945-201ENSMUST00000179609 92 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm12424-201ENSMUST00000179673 447 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700016G22Rik-202ENSMUST00000186843 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1700019P21Rik-201ENSMUST00000186955 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm5539-201ENSMUST00000192177 966 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38242-201ENSMUST00000192354 430 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm26901-204ENSMUST00000193732 631 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7270-202ENSMUST00000195850 1131 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm38405-201ENSMUST00000207760 1140 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Vmn2r-ps88-201ENSMUST00000209168 804 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC133947.1-201ENSMUST00000213336 614 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm46124-202ENSMUST00000217260 860 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm19612-201ENSMUST00000218279 982 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC154528.3-201ENSMUST00000228011 679 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Fam209-201ENSMUST00000029007 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mfap5-201ENSMUST00000032210 946 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Prl3d1-201ENSMUST00000082079 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr1043-201ENSMUST00000099907 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Gsdmc-201ENSMUST00000110125 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Vpreb1P13372 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm36251-201ENSMUST00000213712 1914 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm16701-201ENSMUST00000181309 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tnik-214ENSMUST00000162485 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Spx-204ENSMUST00000211094 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933436H12Rik-203ENSMUST00000207818 1466 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm20501-202ENSMUST00000211303 2194 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Galnt15-202ENSMUST00000164208 3563 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Serpina1a-202ENSMUST00000085056 1360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Elmo1-202ENSMUST00000180626 2020 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Osbpl3-202ENSMUST00000090019 4039 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm12430-201ENSMUST00000121539 1322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Dtwd1-202ENSMUST00000170908 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Tmem69-202ENSMUST00000106478 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Rab3b-203ENSMUST00000106651 1078 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Vpreb1P13372 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms