Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29548-201ENSMUST00000187012 694 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28105-201ENSMUST00000187788 694 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4933403L11Rik-201ENSMUST00000193857 1121 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Pisrt1-201ENSMUST00000195532 515 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm44546-201ENSMUST00000208353 368 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm36849-201ENSMUST00000210345 680 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC131100.1-201ENSMUST00000226328 470 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Mir30c-1-201ENSMUST00000083556 89 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Cfap161-202ENSMUST00000119134 2868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Slitrk4-201ENSMUST00000069926 8494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm4847-201ENSMUST00000046662 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 9330158H04Rik-206ENSMUST00000161161 3103 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Plch1-208ENSMUST00000160638 6271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm3269-201ENSMUST00000166025 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Elf5-201ENSMUST00000028609 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Arfgef1-203ENSMUST00000131556 3424 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gria3-209ENSMUST00000165288 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Csmd2-205ENSMUST00000184063 13555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Zfp455-202ENSMUST00000120861 2712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Satb1-203ENSMUST00000129667 2896 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4930563E22Rik-201ENSMUST00000066087 3313 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Phc3-210ENSMUST00000177992 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ripor2-204ENSMUST00000110383 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Slc5a9-202ENSMUST00000102720 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Trav12-1-201ENSMUST00000103650 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm13160-201ENSMUST00000118441 627 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm12817-201ENSMUST00000119622 610 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm15842-201ENSMUST00000120513 618 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm12811-201ENSMUST00000125237 667 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm11266-201ENSMUST00000139835 1271 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm22949-201ENSMUST00000158562 105 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm26977-201ENSMUST00000183151 996 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm29145-201ENSMUST00000189914 456 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm42997-201ENSMUST00000196074 918 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 4930557K07Rik-201ENSMUST00000205110 363 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Kcne3-207ENSMUST00000208260 929 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm35514-201ENSMUST00000221615 352 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 AC163660.3-202ENSMUST00000224917 464 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm9761-201ENSMUST00000075650 492 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Muc5ac-203ENSMUST00000163321 8505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Mbnl2-203ENSMUST00000226800 3328 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Csde1-211ENSMUST00000198180 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Snapc4-201ENSMUST00000035427 4363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Pclo-202ENSMUST00000182407 16846 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
Prrt4B2RU40 Gm43842-201ENSMUST00000202890 2982 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms