Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Chek2-201ENSMUST00000066160 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ston1-205ENSMUST00000150023 3231 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nif3l1-202ENSMUST00000114337 2168 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tdrd1-203ENSMUST00000111606 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cep112-202ENSMUST00000106715 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13900-201ENSMUST00000119402 498 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14489-201ENSMUST00000120868 901 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14218-201ENSMUST00000137802 595 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26183-201ENSMUST00000157685 139 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-214ENSMUST00000198758 1286 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44227-201ENSMUST00000203576 241 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29154-205ENSMUST00000213325 1112 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 CT009556.4-201ENSMUST00000227092 200 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cd300lb-203ENSMUST00000149663 2641 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mertk-201ENSMUST00000014505 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37069-201ENSMUST00000192742 4142 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 B4galnt3-201ENSMUST00000057283 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Rimbp2-207ENSMUST00000200470 4083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15990-201ENSMUST00000132223 3321 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm42572-201ENSMUST00000202292 3378 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr266-203ENSMUST00000216610 1520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13538-201ENSMUST00000143166 548 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18789-201ENSMUST00000216115 550 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC148328.2-201ENSMUST00000216960 262 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC115304.1-202ENSMUST00000226850 837 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Liph-202ENSMUST00000074230 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Rb1cc1Q9ESK9 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Abcc8-201ENSMUST00000033123 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tsr2-201ENSMUST00000026295 3804 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12511-201ENSMUST00000135987 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ehmt1-204ENSMUST00000114418 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Epas1-201ENSMUST00000024954 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Idi2-201ENSMUST00000038598 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Sept11-203ENSMUST00000201421 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll1-203ENSMUST00000109480 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14863-201ENSMUST00000119648 307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16984-201ENSMUST00000130003 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ptma-204ENSMUST00000188533 593 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 4930471E15Rik-201ENSMUST00000221147 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AV026068-219ENSMUST00000224148 933 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 AC159267.1-201ENSMUST00000226702 678 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Filip1-201ENSMUST00000093811 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Nutm1-201ENSMUST00000043970 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45737-201ENSMUST00000208344 1612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Rb1cc1Q9ESK9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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