Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 CT009550.3-201ENSMUST00000228542 455 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Churc1-201ENSMUST00000041262 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Insig2-202ENSMUST00000071064 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm10123-201ENSMUST00000075723 490 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Lilra5-201ENSMUST00000117550 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Hdhd2-209ENSMUST00000150990 3126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Phactr2-204ENSMUST00000105546 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm37520-201ENSMUST00000194883 2672 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Ankef1-210ENSMUST00000180246 2726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Itih3-201ENSMUST00000006697 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Nprl2-201ENSMUST00000010201 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Garnl3-202ENSMUST00000102810 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 4930513N10Rik-202ENSMUST00000132616 490 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Gm2087-201ENSMUST00000188217 366 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Ercc8Q8CFD5 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Anapc15-210ENSMUST00000144207 3103 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Olfr76-202ENSMUST00000213471 3109 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Duxbl3-201ENSMUST00000100804 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Yes1-202ENSMUST00000168707 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 4930412C18Rik-202ENSMUST00000138390 3839 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Gas2l3-202ENSMUST00000105298 6305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Ercc8Q8CFD5 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ercc8Q8CFD5 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ercc8Q8CFD5 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ercc8Q8CFD5 Rp1-201ENSMUST00000027032 6869 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Ercc8Q8CFD5 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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