Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cdhr1-201ENSMUST00000022337 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43411-201ENSMUST00000196235 1579 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Pnp-203ENSMUST00000048615 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr319-203ENSMUST00000215962 2500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28821-201ENSMUST00000185637 610 ntTSL 3 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm19172-201ENSMUST00000203170 1246 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ly6c1-201ENSMUST00000065408 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rnase1-201ENSMUST00000080126 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Paqr8-201ENSMUST00000068880 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Olfr225-202ENSMUST00000213169 2658 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC155270.1-201ENSMUST00000221626 4028 ntBASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Kantr-207ENSMUST00000195280 4212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cacna1f-202ENSMUST00000115726 6079 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Map2-207ENSMUST00000114018 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Epb41l2-202ENSMUST00000092645 4280 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28945-201ENSMUST00000187780 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm29622-201ENSMUST00000190914 2165 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mapre2-209ENSMUST00000170802 3936 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ociad1-203ENSMUST00000166823 3354 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm38339-201ENSMUST00000195479 1829 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mbtps1-202ENSMUST00000098362 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm13229-201ENSMUST00000118238 340 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm15047-201ENSMUST00000118891 454 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm13857-202ENSMUST00000141091 617 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm27596-201ENSMUST00000185061 83 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm28119-201ENSMUST00000185538 298 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Plekha2-201ENSMUST00000064883 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Ctnnd1-209ENSMUST00000111678 5870 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm2974-201ENSMUST00000164512 1990 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Npy2r-203ENSMUST00000182181 1331 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AC158799.1-204ENSMUST00000217441 1321 ntTSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm8107-201ENSMUST00000117477 2009 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Atf2-201ENSMUST00000055833 4210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gm43023-201ENSMUST00000197583 2106 ntBASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Clec1a-201ENSMUST00000037481 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.02
Siah1bQ06985 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms