Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm12295-201ENSMUST00000128453 3189 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm38099-201ENSMUST00000193280 3170 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm6878-201ENSMUST00000100448 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm27866-201ENSMUST00000184459 171 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1262-201ENSMUST00000061701 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cfap65-201ENSMUST00000094844 5727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm3669-201ENSMUST00000126712 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm2165-202ENSMUST00000129963 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Kalrn-204ENSMUST00000114949 3618 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Catsperg1-202ENSMUST00000069861 2251 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4931403G20Rik-201ENSMUST00000180861 1699 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 3830406C13Rik-201ENSMUST00000112669 2477 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 3830406C13Rik-202ENSMUST00000163392 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Zfp709-203ENSMUST00000188685 7186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 BC025920-201ENSMUST00000099442 2785 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Sestd1-201ENSMUST00000102659 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm37633-201ENSMUST00000192858 2700 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Lhfpl2-202ENSMUST00000118195 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm32742-201ENSMUST00000210433 8516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8728-201ENSMUST00000207367 2178 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8486-201ENSMUST00000207508 2171 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm8685-201ENSMUST00000207567 2183 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm16443-201ENSMUST00000207909 2184 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Zfp661-203ENSMUST00000110368 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm13744-201ENSMUST00000118953 850 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm16580-201ENSMUST00000162696 1044 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm5445-201ENSMUST00000180224 480 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC159205.7-201ENSMUST00000225988 692 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Olfr775-202ENSMUST00000214109 3598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Rpgr-206ENSMUST00000115534 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Hrh2-201ENSMUST00000038101 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cfap58-201ENSMUST00000066308 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Pik3r4-210ENSMUST00000191268 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ccnyl1-201ENSMUST00000094898 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Fam102b-201ENSMUST00000046924 5368 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Cwc22-201ENSMUST00000065889 3471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm43686-201ENSMUST00000197351 2439 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Ifit1-201ENSMUST00000102824 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Nphp4P59240 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Cav1-205ENSMUST00000115456 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm11423-202ENSMUST00000152784 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm22702-201ENSMUST00000175372 69 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm6472-202ENSMUST00000187973 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Spink8-202ENSMUST00000198988 768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Gm29154-253ENSMUST00000217229 1207 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 AC117949.1-201ENSMUST00000225547 419 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Nphp4P59240 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms