Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ctps2-201ENSMUST00000033727 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RxraP28700 Kntc1-201ENSMUST00000031366 6961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Vmn1r176-202ENSMUST00000226319 2930 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Alkbh8-206ENSMUST00000212294 2584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp939-202ENSMUST00000186855 2480 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43430-201ENSMUST00000196513 3897 ntBASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Synj2bp-204ENSMUST00000164431 3305 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Mrgprx2-202ENSMUST00000186394 1930 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
RxraP28700 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ezh1-202ENSMUST00000107284 4207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930453H23Rik-201ENSMUST00000125569 1719 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfhx3-204ENSMUST00000220518 17152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Nr2c1-203ENSMUST00000105290 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 D130007C19Rik-201ENSMUST00000067277 1505 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ccdc60-201ENSMUST00000050178 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm45237-202ENSMUST00000211157 2452 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44850-201ENSMUST00000205621 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm17552-201ENSMUST00000181211 3877 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Amd-ps4-201ENSMUST00000118392 1003 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13921-201ENSMUST00000119411 463 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm15081-201ENSMUST00000119794 844 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm11955-201ENSMUST00000119801 470 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm40614-201ENSMUST00000125161 1254 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pitpnm2os2-202ENSMUST00000162577 744 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp661-204ENSMUST00000164551 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tmem147os-201ENSMUST00000180820 1276 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ank3-208ENSMUST00000182029 3825 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43560-201ENSMUST00000198100 773 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Lsm5-205ENSMUST00000203958 416 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm34418-201ENSMUST00000212879 309 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC132587.1-201ENSMUST00000220562 166 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rpl7a-ps1-201ENSMUST00000223350 793 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cst13-201ENSMUST00000046589 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm10015-201ENSMUST00000072570 465 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm10029-201ENSMUST00000089635 330 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm43099-201ENSMUST00000198943 5241 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Fam60a-211ENSMUST00000204435 2785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Zfp979-202ENSMUST00000105720 2594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC158686.1-201ENSMUST00000218068 2332 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cyp2d12-201ENSMUST00000068861 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
RxraP28700 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Cav1-202ENSMUST00000115453 2746 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rgs19-206ENSMUST00000108778 1427 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Rgs19-212ENSMUST00000165416 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Olfr1241-203ENSMUST00000215055 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Amot-201ENSMUST00000112835 6519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 n-R5s1-201ENSMUST00000101925 119 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 4930449I24Rik-201ENSMUST00000110598 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm14036-201ENSMUST00000118248 480 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm13407-201ENSMUST00000118256 360 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12687-201ENSMUST00000119752 706 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm12870-201ENSMUST00000121383 1016 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 1700025N21Rik-201ENSMUST00000160997 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Krr1-204ENSMUST00000174653 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm26877-201ENSMUST00000180728 633 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 1500004A13Rik-201ENSMUST00000183374 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
RxraP28700 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
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