Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm45202-201ENSMUST00000205955 332 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 AC124715.2-201ENSMUST00000226762 617 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Capsl-201ENSMUST00000042360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr401-201ENSMUST00000079827 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cbx3-ps7-201ENSMUST00000081455 552 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm22748-201ENSMUST00000082493 136 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Rasef-202ENSMUST00000102837 5158 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Akap2-207ENSMUST00000107600 7231 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Trappc13-201ENSMUST00000022224 2342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr324-202ENSMUST00000214990 3624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Zim1-202ENSMUST00000122432 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 3632451O06Rik-201ENSMUST00000036972 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm43623-201ENSMUST00000199289 2663 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Prdm14-201ENSMUST00000047577 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cep41-202ENSMUST00000115130 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm7785-201ENSMUST00000117121 892 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm12024-201ENSMUST00000118819 1253 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm26269-201ENSMUST00000180144 126 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Rnf212-206ENSMUST00000212212 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Trpm3-206ENSMUST00000099569 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Dnajc6-201ENSMUST00000038207 5258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 C87436-203ENSMUST00000113700 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Pnlip-201ENSMUST00000057270 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Dis3l-202ENSMUST00000113890 3224 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Zfp942-202ENSMUST00000091879 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Zfp521-201ENSMUST00000025288 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cts7-201ENSMUST00000021892 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Ankrd6-203ENSMUST00000084749 4573 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm17083-201ENSMUST00000165849 1366 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Srcap-207ENSMUST00000187040 10654 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Klf6-201ENSMUST00000000080 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Il15ra-214ENSMUST00000138349 1936 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm12955-201ENSMUST00000119689 957 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Snrp1c-ps2-201ENSMUST00000120976 365 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm25780-201ENSMUST00000122528 253 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm20587-201ENSMUST00000186367 1186 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm42489-201ENSMUST00000198964 669 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm33096-201ENSMUST00000210189 493 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr472-202ENSMUST00000210420 1083 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm5564-201ENSMUST00000034916 967 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 4930563M21Rik-201ENSMUST00000060468 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 H2al1j-201ENSMUST00000091180 330 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 AC165260.6-202ENSMUST00000224959 1958 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Plau-201ENSMUST00000022368 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Ifit3b-201ENSMUST00000076249 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 St8sia4-201ENSMUST00000043336 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm8836-201ENSMUST00000198196 1348 ntBASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Chm-201ENSMUST00000026607 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Rps20-203ENSMUST00000138502 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Fv1-201ENSMUST00000094481 1380 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Tenm1-201ENSMUST00000016294 8365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Prdm16-206ENSMUST00000105638 8601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
SrprbP47758 Zkscan7-201ENSMUST00000063980 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms