Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm10157-201ENSMUST00000139408 343 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm16015-201ENSMUST00000154897 390 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm7418-201ENSMUST00000162120 801 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm27034-201ENSMUST00000182552 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm30132-202ENSMUST00000212825 819 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC121788.2-201ENSMUST00000218284 1255 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 1700007F19Rik-201ENSMUST00000188418 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Celf2-221ENSMUST00000182706 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Rad54l-201ENSMUST00000102704 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm45708-202ENSMUST00000212785 2752 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Phf11a-201ENSMUST00000062307 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm4849-201ENSMUST00000188428 2246 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Kbtbd3-201ENSMUST00000049648 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Pcdh12-201ENSMUST00000025311 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cep95-201ENSMUST00000018516 2696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Satb1-213ENSMUST00000169480 6194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Mapk14-203ENSMUST00000114752 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ttll4-201ENSMUST00000042125 10019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Prox2-202ENSMUST00000177289 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm15709-201ENSMUST00000118354 213 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm22000-201ENSMUST00000153087 730 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm20797-201ENSMUST00000177894 383 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Il22-201ENSMUST00000096691 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm44080-201ENSMUST00000204451 2214 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Il31ra-206ENSMUST00000224510 2946 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Aasdh-201ENSMUST00000069709 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Caps2-201ENSMUST00000092176 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Dppa2-201ENSMUST00000097175 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cacna1d-209ENSMUST00000224785 8041 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Slc13a1-201ENSMUST00000031713 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cebpz-201ENSMUST00000024885 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Ighv1-17-201ENSMUST00000194435 350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 4930553I21Rik-201ENSMUST00000214016 580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm33782-201ENSMUST00000218518 517 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm32899-201ENSMUST00000219694 207 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm12183-201ENSMUST00000120566 1848 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Gm7562-201ENSMUST00000210502 2537 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Knstrn-206ENSMUST00000134661 4602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr1157-201ENSMUST00000099841 4621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Patj-206ENSMUST00000107033 3624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AC125020.1-201ENSMUST00000220137 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Olfr314-202ENSMUST00000205189 2647 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Cep290-210ENSMUST00000220346 8211 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 Fam217a-201ENSMUST00000021851 2402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 AI506816-205ENSMUST00000199941 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cnga1P29974 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms