Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm2101-203ENSMUST00000133794 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm2117-203ENSMUST00000147993 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TtrP07309 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TtrP07309 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TtrP07309 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Coro2a-201ENSMUST00000030021 4112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr338-201ENSMUST00000072114 5780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gimap6-202ENSMUST00000119315 3179 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Usp8-202ENSMUST00000110416 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm16434-201ENSMUST00000100888 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm6676-201ENSMUST00000166493 2066 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Ankrd49-206ENSMUST00000216372 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr329-ps-201ENSMUST00000108822 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 1810053B23Rik-204ENSMUST00000185971 1309 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm23908-201ENSMUST00000104599 132 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Ap5s1-202ENSMUST00000110206 703 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm3618-201ENSMUST00000112726 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mup-ps24-201ENSMUST00000119939 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm11605-201ENSMUST00000120413 646 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Kcnab3os-201ENSMUST00000136196 566 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm15086-201ENSMUST00000143110 573 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Rubie-201ENSMUST00000151828 1137 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 A930031H19Rik-202ENSMUST00000153810 949 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Dctd-206ENSMUST00000174379 381 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 4930438E09Rik-201ENSMUST00000176841 776 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm21965-201ENSMUST00000177770 384 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 1700009J07Rik-201ENSMUST00000178996 912 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm11109-201ENSMUST00000180289 384 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm15100-201ENSMUST00000180357 573 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Btg1-ps1-202ENSMUST00000184432 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm28980-201ENSMUST00000187877 219 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm28115-201ENSMUST00000188985 360 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Atp5g3-201ENSMUST00000018914 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Kmt5a-212ENSMUST00000198451 1032 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm44151-201ENSMUST00000204704 259 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 4933432K03Rik-201ENSMUST00000205739 1247 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr491-201ENSMUST00000053179 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gm21957-201ENSMUST00000073056 438 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Mir146b-201ENSMUST00000093619 109 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr2-201ENSMUST00000094109 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Olfr305-204ENSMUST00000216700 3734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TtrP07309 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TtrP07309 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TtrP07309 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm28938-201ENSMUST00000187029 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm29399-202ENSMUST00000187292 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm29203-201ENSMUST00000187355 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm29027-202ENSMUST00000187571 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm28249-203ENSMUST00000190011 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm30045-202ENSMUST00000193438 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm32181-202ENSMUST00000194268 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm36345-202ENSMUST00000194949 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm31422-203ENSMUST00000195198 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm30705-203ENSMUST00000195660 1495 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Dmd-202ENSMUST00000113992 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Gm38300-201ENSMUST00000194245 1870 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TtrP07309 Olfr1427-203ENSMUST00000216069 1863 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms