Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Blvrb-203ENSMUST00000108358 951 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm14410-201ENSMUST00000108964 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm5398-201ENSMUST00000121933 984 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Chn1os1-201ENSMUST00000123613 636 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm24063-201ENSMUST00000157491 105 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm23222-201ENSMUST00000158117 76 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm16541-201ENSMUST00000160992 614 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm26726-201ENSMUST00000181889 395 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm7270-202ENSMUST00000195850 1131 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm39465-202ENSMUST00000215177 470 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC123738.1-201ENSMUST00000224796 773 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr214-201ENSMUST00000060204 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr659-201ENSMUST00000098170 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Kpna2-ps-201ENSMUST00000120025 1569 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Zfp791-201ENSMUST00000098550 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm28892-201ENSMUST00000188123 2721 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Birc5-202ENSMUST00000093906 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ap1s3-203ENSMUST00000162342 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm13102-203ENSMUST00000105761 2281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Dock5-201ENSMUST00000039135 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm37159-201ENSMUST00000192720 3605 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm4275-205ENSMUST00000212624 1436 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm44001-201ENSMUST00000203158 3773 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Glt8d2-201ENSMUST00000020485 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ptk2b-208ENSMUST00000178730 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Eml1-201ENSMUST00000054955 3879 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tnip3-207ENSMUST00000212375 1543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm42972-201ENSMUST00000196937 5617 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r90-203ENSMUST00000226510 6674 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 4921525O09Rik-201ENSMUST00000220691 3270 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm43413-201ENSMUST00000200411 1566 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tek-202ENSMUST00000073939 4549 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm11461-201ENSMUST00000119909 387 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm11454-201ENSMUST00000144092 714 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Btnl5-ps-202ENSMUST00000173333 461 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm18821-201ENSMUST00000184135 709 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Scgb1b12-201ENSMUST00000188355 417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm35106-201ENSMUST00000192731 250 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm6578-202ENSMUST00000203684 560 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm2734-201ENSMUST00000208561 743 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC167013.6-201ENSMUST00000226587 1067 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 AC167013.3-201ENSMUST00000228110 989 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Dnajc5b-201ENSMUST00000029132 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Vmn1r210-201ENSMUST00000072044 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm26244-201ENSMUST00000083435 164 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Defa30-201ENSMUST00000098898 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Gm43917-201ENSMUST00000191984 2360 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Olfr15-202ENSMUST00000214238 6135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Hps1O08983 Akap7-201ENSMUST00000041984 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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