Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Aoah-201ENSMUST00000021757 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Calhm2-202ENSMUST00000140512 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Coq8a-217ENSMUST00000170472 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Eif4g2-213ENSMUST00000162415 7995 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Slc8a1-203ENSMUST00000163680 2913 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Slc8a1-201ENSMUST00000086538 2913 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Luzp2-201ENSMUST00000082373 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm24472-201ENSMUST00000104484 132 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm13915-201ENSMUST00000119314 931 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm14528-201ENSMUST00000120615 231 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 4921523L03Rik-201ENSMUST00000175729 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 1700112H15Rik-201ENSMUST00000188766 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm17530-201ENSMUST00000194336 472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm45401-201ENSMUST00000209456 733 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC154487.1-201ENSMUST00000224649 226 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 AC126805.1-201ENSMUST00000225142 262 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Aph1c-201ENSMUST00000057261 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 3830408C21Rik-202ENSMUST00000223895 1689 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Abce1-201ENSMUST00000080536 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 1700074P13Rik-201ENSMUST00000031935 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rars2-201ENSMUST00000029968 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Oacyl-201ENSMUST00000115097 3431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tnni3k-201ENSMUST00000064076 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Chd8-212ENSMUST00000200169 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 BC048644-201ENSMUST00000140928 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Tas1r3-201ENSMUST00000030949 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Trim38-203ENSMUST00000226039 1999 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gykl1-201ENSMUST00000066193 1990 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pwwp2a-203ENSMUST00000109280 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pecam1-203ENSMUST00000103069 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Sorbs2-215ENSMUST00000135336 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 D5Ertd615e-202ENSMUST00000197016 3911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm10619-201ENSMUST00000098372 2695 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Il1bos-202ENSMUST00000156601 2425 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Arl15-201ENSMUST00000091201 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm15834-202ENSMUST00000139825 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr731-204ENSMUST00000214388 5438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm34730-201ENSMUST00000210674 4077 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Igkv3-4-201ENSMUST00000103401 360 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mgst1-207ENSMUST00000140932 742 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm24050-201ENSMUST00000158623 290 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6799-201ENSMUST00000186919 573 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm42767-201ENSMUST00000198583 632 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm42584-201ENSMUST00000201404 220 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm3011-201ENSMUST00000215669 582 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pax9-201ENSMUST00000001538 4166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Plag1-201ENSMUST00000003369 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Wdfy3-205ENSMUST00000174598 10581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Hnmt-203ENSMUST00000114498 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cntnap4-202ENSMUST00000118171 4860 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Adam2-201ENSMUST00000022618 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Supt20-202ENSMUST00000170552 1968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm4863-201ENSMUST00000196907 1381 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Trpm3-201ENSMUST00000037901 5082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Muc4-201ENSMUST00000096106 11277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Ctnnd1-214ENSMUST00000111688 6146 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Hmgxb4-202ENSMUST00000109940 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Fnbp1-201ENSMUST00000073879 8469 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 E130018O15Rik-201ENSMUST00000069741 3776 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Prps1l1-201ENSMUST00000134550 1676 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gprasp2-201ENSMUST00000113136 3736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rnf144b-202ENSMUST00000110111 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Plxna4-201ENSMUST00000115096 12877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gm5681-201ENSMUST00000189217 1533 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Creb1-201ENSMUST00000049932 5009 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rassf6-201ENSMUST00000031317 1958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Aldoart1-202ENSMUST00000179234 2050 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Gsdmc4-202ENSMUST00000188108 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
ScaperF8VQ70 Papss2-201ENSMUST00000025833 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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